sic.c

   1 /*
   2  * sic.c - investigation of the sic precipitation process of silicon carbide
   3  *
   4  * author: Frank Zirkelbach <frank.zirkelbach@physik.uni-augsburg.de>
   5  *
   6  */
   7
   8 #include <math.h>
   9
  10 #include "moldyn.h"
  11 #include "math/math.h"
  12 #include "init/init.h"
  13 #include "visual/visual.h"
  14
  15 #include "posic.h"
  16
  17 #define TRUE 1
  18 #define FALSE 0
  19
  20 int main(int argc,char **argv) {
  21
  22         /* main moldyn structure */
  23         t_moldyn md;
  24
  25         /* potential parameters */
  26         t_lj_params lj;
  27         t_ho_params ho;
  28         t_tersoff_mult_params tp;
  29
  30         /* misc variables, mainly to initialize stuff */
  31         t_3dvec r,v;
  32
  33         /* initialize moldyn */
  34         moldyn_init(&md,argc,argv);
  35
  36         /* choose integration algorithm */
  37         set_int_alg(&md,MOLDYN_INTEGRATE_VERLET);
  38
  39         /* choose potential */
  40         //set_potential(&md,MOLDYN_1BP,tersoff_mult_1bp,&tp);
  41         //set_potential(&md,MOLDYN_2BP,tersoff_mult_2bp,&tp);
  42         //set_potential(&md,MOLDYN_3BP,tersoff_mult_3bp,&tp);
  43         set_potential(&md,MOLDYN_2BP,lennard_jones,&lj);
  44
  45         /*
  46          * potential parameters
  47          */
  48
  49         /* lennard jones */
  50         lj.sigma6=LJ_SIGMA_SI*LJ_SIGMA_SI*LJ_SIGMA;
  51         lj.sigma6*=lj.sigma6;
  52         lj.sigma12=lj.sigma6*lj.sigma6;
  53         lj.epsilon4=4.0*LJ_EPSILON_SI;
  54
  55         /* harmonic oscillator */
  56         ho.equilibrium_distance=0.25*sqrt(3.0)*LC_SI;
  57         ho.spring_constant=1;
  58
  59         /* cutoff radius */
  60         set_cutoff(&md,LC_SI);
  61
  62         /* set (initial) dimensions of simulation volume */
  63         set_dim(&md,10*LC_SI,10*LC_SI,10*LC_SI,TRUE);
  64
  65         /* set periodic boundary conditions in all directions */
  66         set_pbc(&md,TRUE,TRUE,TRUE);
  67
  68         /* create the lattice / place atoms */
  69         memset(&v,0,sizeof(t_3dvec));
  70         r.y=0;
  71         r.z=0;
  72         r.x=0.23*sqrt(3.0)*LC_SI/2.0;
  73         add_atom(&md,SI,M_SI,0,ATOM_ATTR_2BP,&r,&v);
  74         r.x=-r.x;
  75         add_atom(&md,SI,M_SI,0,ATOM_ATTR_2BP,&r,&v);
  76
  77         /* set temperature */
  78         set_temperature(&md,0.0);
  79
  80         /* initial thermal fluctuations of particles */
  81         thermal_init(&md);
  82
  83         /* create the simulation schedule */
  84         moldyn_add_schedule(&md,10000,1.0e-15);
  85
  86         /*
  87          * let's do the actual md algorithm now
  88          *
  89          * integration of newtons equations
  90          */
  91
  92         moldyn_integrate(&md);
  93
  94         /* close */
  95
  96         link_cell_shutdown(&md);
  97
  98         moldyn_shutdown(&md);
  99
 100         return 0;
 101 }
 102