pair_correlation_calc.c

   1 /*
   2  * calcultae pair correlation function
   3  *
   4  * author: frank.zirkelbach@physik.uni-augsburg.de
   5  *
   6  */
   7
   8 #define _GNU_SOURCE
   9 #include <stdio.h>
  10 #include <stdlib.h>
  11 #include <unistd.h>
  12 #include <string.h>
  13 #include <sys/types.h>
  14 #include <sys/stat.h>
  15 #include <fcntl.h>
  16
  17 #include "moldyn.h"
  18
  19 int usage(char *prog) {
  20
  21         printf("\nusage:\n");
  22         printf("  %s <save file> <dr>\n\n",prog);
  23
  24         return -1;
  25 }
  26
  27 int main(int argc,char **argv) {
  28
  29         t_moldyn moldyn;
  30         int ret;
  31         double *stat;
  32         int slots;
  33         int i;
  34         double dr;
  35         int fd;
  36
  37         if(argc!=3) {
  38                 usage(argv[0]);
  39                 return -1;
  40         }
  41
  42         ret=moldyn_read_save_file(&moldyn,argv[1]);
  43         if(ret) {
  44                 printf("[pair corr calc] exit!\n");
  45                 return ret;
  46         }
  47
  48         dr=atof(argv[2]);
  49         slots=(int)(moldyn.cutoff/dr);
  50
  51         stat=(double *)malloc(3*slots*sizeof(double));
  52         if(stat==NULL) {
  53                 perror("[pair corr calc] alloc mem");
  54                 return -1;
  55         }
  56
  57         calculate_pair_correlation(&moldyn,dr,stat);
  58
  59         fd=open("pair_corr_func_ab.txt",
  60                 O_WRONLY|O_CREAT|O_TRUNC,S_IRUSR|S_IWUSR);
  61         dprintf(fd,"# type a - type b bonds\n");
  62         for(i=0;i<slots;i++)
  63                 dprintf(fd,"%f %f\n",i*dr,stat[i]);
  64         close(fd);
  65
  66         fd=open("pair_corr_func_aa.txt",
  67                 O_WRONLY|O_CREAT|O_TRUNC,S_IRUSR|S_IWUSR);
  68         dprintf(fd,"# type a - type a bonds\n");
  69         for(i=0;i<slots;i++)
  70                 dprintf(fd,"%f %f\n",i*dr,stat[slots+i]);
  71         close(fd);
  72
  73         fd=open("pair_corr_func_bb.txt",
  74                 O_WRONLY|O_CREAT|O_TRUNC,S_IRUSR|S_IWUSR);
  75         dprintf(fd,"# type a - type b bonds\n");
  76         for(i=0;i<slots;i++)
  77                 dprintf(fd,"%f %f\n",i*dr,stat[2*slots+i]);
  78         close(fd);
  79
  80         free(stat);
  81
  82         return 0;
  83 }