]> www.hackdaworld.org Git - physik/posic.git/blob - povconv
added renew feature
[physik/posic.git] / povconv
1 #!/bin/sh
2
3 #
4 # convert moldyn output to parcas/rasmol output
5 # frank.zirkelbach@physik.uni-augsburg.de
6 #
7
8 #if [ ! -d $1 ]; then
9 #        echo "no valid directory"
10 #        exit 1
11 #fi
12
13 TRG="mdlat.in.xyz"
14
15 rm -f $TRG
16
17 ((frame=1))
18
19 #for file in $1/atomic_conf_*.xyz; do
20
21 file=$1
22
23         count=`grep '# \[P\]' $file | awk '{ print $3 }'`
24         time=`grep '# \[P\]' $file | awk '{ print $4 }'`
25         x0=`grep '# \[D\]' $file | head -n 1 | awk '{ print $3 '}`
26         y0=`grep '# \[D\]' $file | head -n 1 | awk '{ print $4 '}`
27         z0=`grep '# \[D\]' $file | head -n 1 | awk '{ print $5 '}`
28         x1=`grep '# \[D\]' $file | tail -n 1 | awk '{ print $3 '}`
29         y1=`grep '# \[D\]' $file | tail -n 1 | awk '{ print $4 '}`
30         z1=`grep '# \[D\]' $file | tail -n 1 | awk '{ print $5 '}`
31         dimx=`echo $x0 $x1 | awk '{ print $2-$1 }'`
32         dimy=`echo $y0 $y1 | awk '{ print $2-$1 }'`
33         dimz=`echo $z0 $z1 | awk '{ print $2-$1 }'`
34
35         echo "   $count" >> $TRG
36         echo " Frame number $frame $time fs boxsize $dimx $dimy $dimz" >> $TRG
37
38         ((ac=1))
39
40         cat $file | grep -v '^#' | while read name x y z color temp; do
41                 # well, i only use Si and C
42                 [ "$name" = "Si" ] && type=0
43                 [ "$name" = "C" ] && type=1
44                 #echo "$name $x $y $z $type ${ac}" >> $TRG
45                 echo "$name $x $y $z $type" >> $TRG
46                 ((ac+=1))
47         done
48
49         ((frame+=1))
50 #done
51
52