calc_delta_e

   1 #!/bin/bash
   2
   3 # guess potential
   4 pot=`grep ^potential $1/config | awk '{ print $2 }'`
   5
   6 echo
   7 if [ "$pot" = "tersoff" ]; then
   8 echo "potential: $pot"
   9 musi=-4.629595
  10 muc=-7.421824
  11 music=-12.37363
  12 else
  13 echo "potential: $pot"
  14 musi=-4.628414
  15 muc=-7.373091
  16 music=-12.679618
  17 fi
  18 echo
  19
  20 file=`ls $1/atomic_conf_* | tail -1`
  21 atom_cnt=`grep '# \[P\]' $file | awk '{ print $3 }'`
  22 e0=`awk 'NR==2' $1/energy | awk '{ print $3 }'`
  23 e1=`tail -n 1 $1/energy | awk '{ print $3 }'`
  24 ed0=`awk 'NR==2' $1/energy | awk '{ print $6 }'`
  25 ed1=`tail -n 1 $1/energy | awk '{ print $6 }'`
  26 si_cnt=`grep ^Si $file | wc -l`
  27 c_cnt=`grep ^C $file | wc -l`
  28
  29 echo "-------------------------------------------------------------------------"
  30 echo "  Formation energy [eV]: #Si=$si_cnt, #C=$c_cnt, #tot=$atom_cnt"
  31 echo "-------------------------------------------------------------------------"
  32
  33 echo "$si_cnt $c_cnt $e1 $e0" | \
  34         awk '{ print "   Gao: "($3-$4)*($1+$2) }'
  35 echo "$si_cnt $c_cnt $musi $muc $e1 $music" | \
  36         #awk '{ print "   Posselt: "$5*($1+$2)-0.5*($1+$2)*$6-0.5*($1-$2)*($3-$4) }'
  37         awk '{ print "   Posselt: "$5*($1+$2)-$1*$3-$2*$4 }'
  38 echo "$si_cnt $c_cnt $musi $music $e1 $music" | \
  39         awk '{ print "   Tersoff: "$5*($1+$2)-$1*$3-$2*($4-$3) }'
  40